大肠肝菌和酵母菌在结构上的主要区别是大肠杆菌没有细胞核。大肠肝菌是细菌，属于原核生物，具有由肽聚糖组成的细胞壁，只含有核糖体简单的细胞器，没有细胞核。酵母菌是单细胞真核微生物，具有典型的真核细胞结构，有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质、液泡、线粒体。