从目前的情况来看，阿里巴巴涉嫌垄断行为被调查一事对余额宝的安全性没有直接影响。余额宝的本质是一种货币基金产品，由天弘基金公司发行，而支付宝仅作为销售渠道。用户将钱投入余额宝，实际上是购买了这只基金产品的份额，而基金产品的运作和资产托管是由基金公司和托管银行负责的。

此外，阿里巴巴和余额宝所属的蚂蚁集团虽然是关联公司，但它们在法律上是两个独立的企业。因此，即使阿里巴巴受到调查，也不会对余额宝的运营和安全产生直接影响。

综上所述，从目前的情况来看，阿里巴巴被查不会影响余额宝的安全。余额宝作为一款金融产品，其安全性还取决于基金公司的管理能力、市场环境以及监管部门的政策等多方面因素。在投资余额宝时，用户应注意关注这些因素，确保资产安全。