纸箱包装的娃哈哈比薄膜装贵，主要是由于纸箱包装相对于薄膜装在多个方面存在成本差异。

首先，纸箱包装在制造过程中涉及更多的工艺和材料。纸箱通常由纸板或纸板复合材料制成，需要经过多道工序如印刷、模切、粘合等才能形成最终的包装形式。而薄膜装则相对简单，只需将产品用薄膜包裹即可。因此，纸箱包装的材料和制造成本相对较高。

其次，纸箱包装在运输和存储过程中具有更好的保护性能。纸箱结构坚固，能够有效地防止产品在运输过程中的碰撞和损坏，同时也更容易堆放和存储。相比之下，薄膜装的保护性能较差，可能需要额外的包装或防护措施。这也增加了使用纸箱包装的成本。

最后，纸箱包装通常被认为更环保。纸箱材料可以回收再利用，减少对环境的影响。而一些薄膜材料可能较难降解或回收，对环境造成一定压力。因此，随着社会对环保要求的提高，纸箱包装的成本也可能会相应增加。

综上所述，纸箱包装的娃哈哈比薄膜装贵，主要是由于纸箱包装在制造、运输、存储和环保等方面的成本较高。然而，具体价格差异还会受到市场供需、品牌定位、消费者偏好等多种因素的影响。