兔子在半夜叫可能是因为以下几种原因：

1.性行为：兔子在繁殖季节会有性行为，其中包含了一定数量的叫声。

2.惊吓：若兔子感觉到恐惧，激动或直接逼近其巢穴时，兔子会发出警告信号以保护自己。

3.生病：某些兔子会在生病时发出异常的声音，如果它们的行为不正常或表现出异常症状，你可能需要听一下它是否在不自觉地发出不寻常的声音。

4.孤独感：兔子是社交动物，他们需要人陪伴。如果它们孤独感强烈，也会通过发出哀伤、悲哀的呼声来表达他们的情感。

总之，要想确切知道兔子为何在夜间叫，建议观察它们的行为并与专业的兽医咨询讨论。