浙江万邦医药有限公司和安徽万邦医疗有限公司虽然都带有“万邦”二字，但它们实际上是两家独立的公司，在多个方面存在显著的区别。

首先，从地理位置上看，浙江万邦医药有限公司位于浙江省温岭经济开发区，而安徽万邦医疗有限公司则位于安徽省。这种地理差异可能导致两家公司在采购、市场布局和客户服务等方面有不同的策略。

其次，从业务范围来看，浙江万邦医药有限公司主要从事医药原料药及其制剂产品的研制、开发和生产经营，具有现代化的制药设施和强大的研发力量。而安徽万邦医疗有限公司的业务范围可能有所不同，具体涉及哪些医疗领域的业务和服务需要进一步了解。

此外，两家公司在企业文化、管理理念、团队构成等方面也可能存在差异。这些差异可能源于公司的不同发展历程、战略定位和市场环境等因素。

综上所述，浙江万邦医药有限公司和安徽万邦医疗有限公司虽然都是“万邦”品牌下的企业，但在地理位置、业务范围、企业文化等方面存在明显的区别。