根据瑞幸咖啡官方网站和APP显示，瑞幸咖啡舟山慈航码头入口店可以使用瑞幸咖啡的优惠券。但由于个别商家和门店经营状态不一，也存在促销活动优惠范围有所不同的情况。因此，可以尝试联系瑞幸咖啡客服或到该门店咨询店员确认该店是否支持使用瑞幸咖啡的优惠券。