药店只卖原味合生元益生菌的原因主要有以下几点：

1. 受众需求：原味益生菌受众更广，有些人可能不喜欢带有口味的益生菌，而喜欢原味的。同时，对于喜欢口味的人，原味也是一个不错的选择，因为其他口味可能会过于甜腻。

2. 成本考虑：药店在库存成本方面需要考虑。如果药店铺货多种口味，库存成本会相对较高，不利于商家盈利。而原味益生菌则可以降低库存成本，提高利润。

3. 网店库存成本较低：网店在库存成本方面相对较低，因此可以销售多种口味的益生菌。实体药店则受限于库存成本，通常只销售原味益生菌。

4. 产品定位：合生元益生菌原味定位为日常保健品，适合不同年龄段的人群。而其他口味可能更针对特定年龄段或口味偏好的人群，因此原味更适合药店销售。

5. 销售策略：药店在销售合生元益生菌时，可能会根据市场需求和销售情况调整产品种类。原味益生菌作为主力产品，销售较好，因此药店更倾向于销售原味。

总之，药店只卖原味合生元益生菌主要是出于成本、受众需求、产品定位和销售策略的考虑。虽然网店可以销售多种口味，但实体药店受限于库存成本和市场需求，通常只销售原味益生菌。