车位合同作为转让协议的原因主要基于车位的产权和使用权问题。车位合同通常是针对车位出租或出售双方，为明确车位使用权和费用等问题而签订的。这种合同形式，即转让协议，确保了双方在车位使用权转让过程中的权益得到保障。

首先，车位产权可能属于国家或开发商。对于人防车位，所有权归国家所有，但收益权通常由投资人享有。投资人可在非战时将车位使用权进行转让，但无权出让车位所有权。对于出让车位，所有权人可自由转让该车位所有权。因此，当双方就车位使用权进行交易时，需要签订转让协议来明确双方的权利和义务。

其次，车位使用权转让协议具有有限期限、专有性和继承性等特点。根据合同约定，车位使用权在一定时间内有效，期限届满后自动终止。此外，车位使用权具有排他性和专有性，只有使用权持有人才有权使用该车位。这些特点使得车位使用权转让协议成为一种必要的法律文件，以确保双方的权益不受侵犯。

最后，通过签订车位合同作为转让协议，双方可以充分了解和确认合同内容，并对关键条款进行认真阅读和理解。这有助于避免潜在纠纷，并确保双方在车位使用权转让过程中的权益得到平等保护。

综上所述，车位合同作为转让协议的原因主要在于车位的产权和使用权问题，以及确保双方在车位使用权转让过程中的权益得到保障。