一是目标导向不同。“3+1+2”的模式既体现了物理、历史学科的基础性作用，突出了普通高校不同学科专业选才的要求，也更加注重学生的全面发展，提高学生的综合素质。

二是选择科目组合不同。“3+1+2”的模式下，学生可根据个人爱好、兴趣、特长和拟报考高校及专业的招生要求以及高中学校的办学条件，在12种组合中自主选择，增大了考生的选择面。而传统文理分科仅有2种固定的组合供考生选择。其中，文科考生只能选择思想政治、历史、地理1种固定组合，理科考生只能选择物理、化学、生物学1种固定组合。

三是考试内容不同。“3+1+2”的模式中，学生参加全国统一高考的语文、数学、外语3个科目考试时不分文理科，所有考生的考试试卷完全一致。而传统文理分科的数学考试科目，试卷的内容和难度则是有区分的。