兽用自喷漆和普通自喷漆在主要功能和用途上存在显著区别。兽用自喷漆专为动物标识设计，如牲畜、宠物等，采用对动物安全无害的成分，并能在动物皮肤上形成持久、易读的标识。

而普通自喷漆主要用于物体表面如金属、塑料、木材等的装饰和标记，其成分可能对动物有害。因此，在使用时务必区分，确保正确、安全地应用于目标对象。