财政项目资金的会计处理需要遵守《企业会计准则》和相关财政、税务政策。以下是一般的会计处理步骤和注意事项，具体操作还需结合企业的实际情况和会计政策进行调整：

收到财政项目资金时：

借：银行存款或其他应收款

贷：专项应付款—项目名称

使用财政项目资金时：

借：在建工程、研发支出、固定资产等（根据资金使用的具体项目）

贷：专项应付款—项目名称

如果财政项目资金用于支付给其他公司（如B公司），且无特殊规定，一般不应直接将资金支付给第三方，除非是代收代付的情况。如果确实需要支付给第三方，需符合相关政策和规定，并有相应的文件支持。

年底前，如果项目未完工，仍有剩余资金，通常不做特殊处理。项目完工后，如有结余，需要根据财政部门的指示进行处理，可能需要上交或留在企业用于其他项目。