填写金蝶电子记账凭证时，首先需要填写凭证日期、凭证字号和摘要。然后，根据业务情况选择填写借方或贷方科目，填写科目代码和科目名称。

接下来，填写金额，借方金额填写在借方栏，贷方金额填写在贷方栏。如果有多个借方或贷方科目，可以点击“增加分录”按钮添加。

最后，核对凭证信息无误后，点击保存即可完成填写。填写凭证时要注意科目的准确性和金额的平衡性，确保凭证的准确性和完整性。