支付宝公交扣费一般不会出现延迟的情况。支付宝公交扣费是通过扫码支付的方式进行的，扫码支付成功后，扣费金额会立即从支付宝账户中扣除，不会出现延迟的情况。如果出现扣费延迟的情况，可能是由于网络延迟或其他原因造成的，但这种情况比较少见。