小朋友舞蹈考级不在一个机构是可以的。只要考生所考取的证书属于同一个体系，就可以更换不同的机构进行考试。但需要注意的是，如果考生已经获得了一个机构的证书，想更换机构进行考试，需要确认所更换的机构的体系是否与原证书体系相符，如果不符则无法通用。因此，考生在选择机构时需要仔细考虑，确保所选择的机构符合自己的需求和要求。