国家自然基金参与人的限制主要包括以下三方面：

首先，参与人必须具有中国国籍；

其次，参与人所在的单位需为具有独立法人资格的科研机构或高等院校；

最后，参与人需具备在相关领域内承担科研任务的业务能力。此外，参与人还需具备一定的学术素质和道德品质，在科研过程中遵守科研伦理，保证研究成果的真实性、严谨性和可靠性。除此之外，还要注意遵守国家法律法规和基金管理规定，确保科研活动的合法性和规范性。