并入当年综合所得和不并入的主要区别在于计算个人所得税的方式不同。

当年综合所得的并入指的是将各类收入（如工资、薪金所得、经营所得、财产租赁所得等）进行合并计算，然后按照税率表确定应纳税额。这种方式适用于个人总收入较高或多来源收入的情况，税率较高的收入将对个人所得税产生较大影响。并入当年综合所得的好处是能够避免重复计税，也可以更公平地计税。

不并入当年综合所得意味着各类收入独立计算个人所得税，即按照每类收入单独计算税额，然后进行相应的税收减免。这种方式适用于收入来源较为单一或者有一些特定收入来源享受一定税收优惠政策的情况。不并入当年综合所得的好处是个人可以根据不同收入类型的税收政策进行合理的税务规划，降低纳税负担。

需要注意的是，个人所得税的具体计算方式和政策可能会因国家或地区的法律规定而有所不同。因此，具体应根据相关法律法规进行个人所得税的计算和申报。