主要区别在于它们的材料来源和用途不同。水溶肥料是一种能够完全溶解于水的含氮、磷、钾、钙、镁、微量元素、氨基酸、腐植酸、海藻酸等复合型肥料，适用于各种土壤和作物的施肥，从形态上分为固体水溶肥和液体水溶肥两种。而营养液主要指配制的含有植物所需养分的液体培养基，通常是利用无土栽培等技术来进行植物栽种，适用于室内或者无土栽培环境，提供了植物所需的各种生长必需元素和微量元素，能够满足植物生长的需要。

因此，虽然两者都是水溶性的营养物质，但水溶肥料更多地应用于土壤中的施肥，而营养液则主要用于现代化的无土栽培或室内种植环境。