原色大鳄和普通大鳄的主要区别在于它们的外观特征和基因。

1. 外观特征：原色大鳄一般全身呈现出鲜艳、明亮的颜色，通常是红色、蓝色、黄色等鲜艳的原色。而普通大鳄的外观通常是深棕色或灰色，没有明亮的原色。

2. 基因：原色大鳄是一种经过基因突变选育而来的特殊品种，它们携带了特定基因，造成了其鲜明的颜色。普通大鳄则是自然遗传的衍生物种。

值得注意的是，原色大鳄是通过人工干预培育出来的，而非自然产生的物种。这些鲜艳的颜色在自然环境中可能会使它们容易被捕食者发现，从而增加了生存的困难。