区别在于它们的生长环境和生长方式。野生刺参生长于深海区域，没有污染，纯天然生长，生长周期长且蕴含的营养极其丰富。人工养殖刺参则水位低，光照足则生长周期短，营养积累相对低。

有的养殖户为了促进刺参生长以及防病虫害，水池及饲料中会添加药物，养殖刺参体内的残留药物对人体有潜在的危害。