印刷机PF版与FS版的主要区别如下：

PF版即平版，主要用于胶印，其制版过程较简单，常用于报纸、海报等大量印刷。PF版印刷清晰，网点均匀，但耐印力较差，容易出现水纹现象。

FS版即凸版，主要用于凸版印刷，如树脂版印刷机等。FS版印刷的文字和图像比较清晰，且耐印力较高，但制版过程较为复杂，成本较高。

总的来说，PF版和FS版各有优缺点，选择哪种印刷方式需要根据实际情况而定。