绑定企业支付宝有利于店铺的资金管理和财务透明度，提高资金安全性；有利于店铺建立和维护良好的银行征信，提高店铺的信誉度；同时，企业支付宝可以享受更多便捷的金融服务，如网商贷等。

但绑定企业支付宝也存在一定的弊端，如对店铺的财务信息透明度要求较高，财务管理压力更大，而且绑定企业支付宝后，店铺的资金不能直接提现到个人账户，需要通过企业转账的方式进行资金周转，操作较为繁琐。