污水直通井和雨水直通井是用于处理不同类型水的设施。以下是它们的区别：

1. 水源：污水直通井是指将生活污水或工业废水直接排入地下井中，在井中经过分解和过滤处理后，再排入地下水或河流。而雨水直通井是指将雨水收集后直接排入地下井中，无需经过处理。

2. 水质：污水直通井中的水含有各种有害物质和细菌，需要进行处理才能达到排放标准。而雨水直通井中的水相对较清洁，主要是收集雨水并排放。

3. 设计：污水直通井需要经过处理系统，包括沉淀池、曝气池、生物滤池等，以确保排放的水质符合标准。而雨水直通井只需建造井口和井筒，无需其他处理设备。

4. 管理：污水直通井需要定期清理和维护处理设备，以确保其正常运行和排放的水质达标。而雨水直通井只需定期清理井筒，以防止堵塞。

综上所述，污水直通井和雨水直通井主要区别在于水源、水质、设计和管理等方面。