自己交的农合和公司五险不冲突。

1. 农合是农民社会保险，而公司五险是职工社会保险，两者的缴费机构和范围不同。

2. 农合是农民自行缴纳的社会保险，而公司五险是由公司为员工代缴的，两者的缴费方式和来源也不同。

3. 农合和公司五险的覆盖范围和保障内容也存在差异，农合主要针对农民的医疗保障，而公司五险包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等多个方面。

综上所述，自己交的农合和公司五险之间没有冲突，可以同时参保，获得更全面的社会保障。