蛋白棉和羊绒棉在过滤作用上有所不同。蛋白棉主要用于净化鱼缸中的黄水，它能有效去除由沉木或用药引起的黄水，只需将其放置在水流循环的地方即可，且蛋白棉可以反复使用。

而羊绒棉则以其高密度纤维和良好的透水性能著称，它不仅能拦截悬浮固体颗粒、杂质和残饵等污染物，更能快速培养硝化细菌，有助于改善鱼缸水质，打造一个更健康的养鱼环境。因此，在选择时，可以根据不同的需求来挑选适合的过滤棉。