鳄龟用20厘米深的水养比较好，体型大的也可以用50厘米深的水。它在野外就是生活在深水中，尤其是雌龟，如果不是繁殖的话，几乎不会上岸。如果是小一点的龟，则不能一开始就用深水，水深可以先到达龟背，等它适应之后再慢慢加水。需要注意的是，深水养鳄龟也需要提供一个晒台，好让它可以晒晒太阳。