周转箱过滤水泵与出水口的位置关系并非固定为对角。实际上，周转箱过滤水泵与出水口的位置取决于具体的过滤系统设计和鱼缸布局。

在某些情况下，为了优化水流和过滤效果，可能会将出水口设置在与水泵对角的位置。但在其他情况下，出水口可能位于水泵的侧面或其他位置。因此，无法一概而论说周转箱过滤水泵与出水口一定是对角关系。需要根据具体的过滤系统设计和鱼缸布局来确定最佳位置。