盖章的签批单归档，首先需要确保归档的文件至少有一份双方盖章的原件。业务部门如有需求可以保留复印件或者在签署时增加合同份数。公司统一的合同归档管理部门一定要归档合同原件（除电子合同外）。

完成归档后，应在5个工作日内将合同文本原件交至公司法务部归档，并在《合同审批备案记录表》上签字。法务部存档应建立电子档案目录。

对于文件的处理，一般将有文件处理单的放在最后；但如果已粘贴牢固的可放在最前面，这样可以作为首页加盖归档章，从而更好地保护正本的原始面貌。再次应将“件”内的各页按一定方式对齐，便于将来翻阅利用。一般来说，采用左上角装订的，应将左、上侧对齐；采用左侧装订的，应将左、下侧对齐。

对于电子签名的归档保存方案，需要考虑如何有效地维护所含、所附的电子签名的有效性。