在北京上班的外地农业户口退休时是否能补缴医保，取决于具体的政策规定和个人的情况。

一般来说，如果在退休时医疗保险的缴费年限不足，是可以进行补缴的。具体的补缴条件和流程可能会因个人的具体情况、户籍情况、社保缴纳情况等因素而有所不同。例如，一些政策可能规定，在达到法定退休年龄时，如果医疗保险的缴费年限不足，需要补齐一定的年限才能享受医疗保险待遇。

此外，对于补缴医保的时间、金额等也可能会有具体的规定。因此，建议在退休前提前了解相关的政策和规定，以便及时做好补缴医保的准备。

需要注意的是，具体的补缴政策和规定可能会随着时间和政策的变化而有所调整。因此，建议在需要补缴医保时，及时咨询当地社保部门或相关机构，以获取最新的政策和规定信息。