主要位于染色体着丝粒端粒部分的DNA是端粒序列。端粒序列是由重复出现的短DNA序列单元(TTAGGG)组成，它们覆盖在染色体末端的末端区域。端粒序列在染色体的保护和稳定过程中发挥了关键作用。它们通过在染色体末端形成一个“盖子”，防止染色体末端被当做DNA损伤处理。

此外，它们还可以在DNA复制时保护染色体末端不被剪切，从而避免了DNA片段的丢失和基因组不稳定性的出现。端粒序列的缩短和损伤与人类的衰老、癌症、细胞凋亡和染色体异常等疾病有关。