仲裁在判定员工严重违规时，通常会考虑以下因素：

员工的行为是否违反了公司的规章制度、劳动合同或法律法规。

员工的行为是否造成了重大损失或严重影响了公司的声誉和利益。

员工是否故意或过失地违反了规定。

员工是否曾经有过类似的违规行为记录。

如果员工的行为被认定为严重违规，仲裁机构可能会裁决员工承担相应的经济赔偿、纪律处分等责任。在某些情况下，员工可能会被解雇或受到其他更严厉的处罚。