金蝶KIS专业版在初始化时设置核算项目需要遵循以下步骤：

1. **运行软件并登录**：启动金蝶KIS专业版软件，使用您的用户账号进行登录。

2. **进入基础设置**：在系统主界面，依次点击菜单栏中的【基础设置】-【财务资料】-【会计科目】进入会计科目设置界面。

3. **修改会计科目**：在会计科目设置界面中，选择您需要设置核算项目的科目，例如【应收账款】。然后点击工具条上的【修改】按钮来编辑该科目信息。

4. **增加核算项目类别**：在科目修改界面中，单击【核算项目】页签，然后点击【增加核算项目类别】。在弹出的窗口中，您可以根据需要添加新的核算项目类别，比如客户、供应商等。

5. **维护核算项目**：确保您已经在核算项目管理中维护好所有需要的明细功能，如客户、供应商等。这些将作为核算项目被添加到科目设置中。

6. **设置下级组**：如果需要建立下级组，可以使用‘.’来分隔上级组和下级组，以创建更详细的层次结构。

7. **录入期初余额**：完成上述步骤后，还需要录入科目的期初余额。这可以通过【初始化】-【财务初始化】-【科目初始数据】来进行，建议手工录入期初数据，以保证数据的准确性。

8. **其他相关设置**：除了核算项目设置外，还需要对账套进行其他相关设置，如凭证、账簿、税务银行等选项卡的配置，以及高级设置选项的调整。

总之，完成以上步骤后，您的金蝶KIS专业版核算项目应该就设置好了。如果在设置过程中遇到任何问题，建议参考金蝶KIS专业版的帮助文档或联系金蝶的技术支持服务获取帮助。