划拨自建房屋抵押程序包括以下几个步骤：

1.核查房屋产权证书、建筑许可证等资料；

2.申请贷款，提供房屋抵押物，填写相关贷款合同；

3.委托估价公司对房屋进行评估；

4.由银行审核贷款材料并决定是否批准贷款；

5.签署抵押合同，办理房屋抵押手续；

6.将贷款资金划拨到借款人账户中，完成交易。在此过程中需要注意相关手续的齐备、规范，确保房屋抵押贷款安全、稳妥。