电磁阀3瓦和5瓦的主要区别在于功率和耗电量。5瓦的电磁阀比3瓦的电磁阀需要更多的电能来驱动，因此其功率更高。

在性能方面，高功率的电磁阀通常具有更大的流量和更快的开关速度，这可能使其更适合某些需要高流量或快速响应的应用。

然而，选择适合特定应用的电磁阀并不仅仅取决于功率，还需要考虑其他因素，如流体特性、阀芯类型、工作压差等。因此，在选择电磁阀时，应咨询专业人员或阀门制造商的建议。